La Escuela Profesional de Medicina nació un 10 de julio del año 2003 a través de la Resolución N° 0737-2012- UPeU-CU, creada como la Escuela Académico Profesional de Medicina.
Fue así que un 05 de junio del 2008, gracias al voto del Consejo Universitario N° 08-0649, se instala la Comisión Organizadora de la Carrera de Medicina Humana bajo la presidencia del Dr. Luis Felipe Segura Chávez.
El currículo de la Escuela Académico Profesional de Medicina fue aprobado con fecha 12 de enero del 2012, siendo Rector de la Universidad el Dr. Juan Choque Fernández.
Contando con los requisitos listos, el 13 de abril del 2012, la Conferencia General de la Iglesia Adventista, aprueba la apertura de la carrera de Medicina Humana
El primer director de la escuela fue el Dr. Carlos Balarezo, quien asume dicha responsabilidad desde el 2012 hasta enero del 2015.
A partir del 1 de febrero del 2015, el Dr. Roger Albornoz Esteban continua las funciones de director de la Escuela hasta el 31 de diciembre del 2019.
El 01 de enero del 2020 asume como director de Escuela el Dr. Luis Felipe Segura Chávez, hasta la fecha.
Actualmente la escuela de medicina se encuentra en el décimo año de vida institucional con cuatro promociones de egresados. Siempre es buen momento para agradecer la mano guiadora de Dios en nuestra institución.